本實驗技術課程的目標在於使學員了解與熟悉蛋白體學相關的實驗技術與分析方法，使學員能在將來應用此課程所學於藥物開發與醫療診斷研發等相關研究。
本課程擬利用台大醫學卓越研究中心蛋白體暨蛋白質功能核心實驗室的設備進行包括樣品製備，二維電泳分析、膠體的固定與染色、電泳結果的掃描與分析，以及後續的 LC/MS/MS 質譜分析。另外，將會利用台大醫學院基醫大樓410實驗室之MALDI-TOF質譜儀進行蛋白質的鑑定分析。本課程所利用的場地皆具有完善的實驗操作台以及相關設備。基於空間限制，本課程最多可容納實習學員二十人，將分組實地操作。本課程並將配合舉辦MALDI-TOF與LC/MS/MS質譜圖譜結果之分析、比對、解讀與預測的講習會。